NovaSeq X系列
将先进的化学、光学和信息学技术相结合,实现了超凡的速度和数据质量、出色的通量和可扩展性。
使用涵盖所有主要变异类别以及来自FFPE组织的基因特征(TMB、MSI和HRD)的大型泛癌panel实现CGP。
分析时间
手动操作时间
起始量
TruSight Oncology 500 HRD现已上市。通过可靠、准确的同源重组缺陷(HRD)评估实现全面的基因组分析。暂未在日本推出。
TruSight Oncology 500(TSO 500)是一种NGS检测方法,可从FFPE组织进行内部全景基因组分析(CGP)。
评价与指南和临床试验一致的500多种泛癌种生物标志物,以增加单次检测发现阳性生物标志物的机会。使用可选的附加HRD试剂盒评估基因组不稳定性。†
使用与即用型DRAGEN二级分析流程集成的手动或自动化工作流程,通过本地服务器或Illumina Connected Analytics的云端,在4-5天内即可获得结果。使用多种选项获取见解并生成报告,包括Illumina Connected Insights‡或Pierian。
*不适用于TSO 500 HRD。
†HRD仅适用于在TruSight Oncology 500中添加TruSight Oncology 500 HRD试剂盒的情况。暂未在日本推出。
‡仅在部分国家/地区上市。Illumina Connected Insights通过对第三方知识库的API调用,支持用户自定义的三级分析。
使用TruSight Oncology 500产品系列鉴定用于临床研究的疾病相关生物标志物。
评估FFPE肿瘤组织中的相关DNA和RNA癌症生物标志物(现可通过配套试剂盒支持检测HRD),可评估基因组不稳定性评分(GIS)。†
TruSight Oncology 500 High-Throughput(大样本量方案)
使用与TruSight Oncology 500相同的panel内容和组织起始量类型时,一次最多可批量处理192个样本。
通过液体活检分析血浆中的循环肿瘤DNA(ctDNA),DNA panel内容与TruSight Oncology 500相似。
| 分析时间 | 4-5天完成从样本起始到最终结果的整个流程 |
|---|---|
| 自动化功能 | 液体处理机器人 |
| 自动化详情 | 探索可用的自动化方法 |
| 癌症类型 | 泛癌种, 实体瘤 |
| 试剂盒应用 |
对523个基因的DNA和55个基因的RNA进行靶向测序,panel总共1.94 Mb。包括MSI和TMB检测。 整合的HRD检测panel † 覆盖约25,000个SNP,可通过由Myriad Genetics提供支持的综合基因组不稳定性评分(LOH+TAI+LST)来评估同源重组修复缺陷。 †日本尚不支持购买TruSight Oncology 500 v2 |
| 说明 | 可利用FFPE组织中的DNA和RNA对实体瘤进行全景变异分析。通过单个样本实现实现变异检测和生物标志物评估,以进行广泛的肿瘤特征分析。 |
| 手动操作时间 |
自动工作流程约2.5小时 手动工作流程约10.5小时 |
| 起始量 | 30 ng DNA(最低10 ng),40 ng RNA(最低20 ng) |
| 系统 | NextSeq 550桌面式基因测序仪, 研究模式下的NextSeq 550Dx, NextSeq 500桌面式基因测序仪 |
| 方法 | 靶向DNA测序, 靶向RNA测序, 靶向富集 |
| 多重分析 | NextSeq 550/Dx:8样本/运行。 NextSeq™ 1000和2000:P2流动槽运行8样本,P3流动槽24样本,P4流动槽36样本。NovaSeq™ 6000/Dx:SP流动槽运行16样本,S1流动槽32样本,S2流动槽72样本,S4流动槽192样本。 NovaSeq X/X Plus:1.5B卡盒分析32样本,10B卡盒192样本,25B卡盒480样本。 |
| 核酸类型 | DNA, RNA |
| 特殊的样本类型 | FFPE组织 |
| 物种 | 人 |
| 技术 | Illumina测序 |
| 变异类别 | 基因融合, 转录本变异, 单核苷酸位点变异(SNV), 插入缺失(indel), 拷贝数变异(CNV), 杂合性缺失(LOH), 体细胞变异, 新型转录本, 单核苷酸多态性(SNP), 结构变异 |
要运行TSO 500,您需要:
要使用DRAGEN变异检出流程进行分析,您需要:
要生成最终报告,您需要:
TruSight Oncology 500能够对FFPE肿瘤样本进行全面的基因组分析,使用更少的样本评估各种生物标志物,与单基因或小型panel检测相比,结果更多。
TruSight Oncology 500检测
| 仪器 | 推荐的样本数 | 读长 |
|---|---|---|
| NextSeq 500桌面式基因测序仪 | 每次运行8个样本(高通量流动槽),100 M双端read,3,500×覆盖度 |
2 × 101 bp |
| 研究模式下的NextSeq 550Dx | 每次运行8个样本(高通量流动槽),100 M双端read,3,500×覆盖度 |
2 × 101 bp |
我们的临床癌症研究解决方案能提供准确的基因组信息,让实验室能够在单次检测中分析多个基因。
与单基因和基于阵列的方法相比,基于 NGS 的癌症测序方法可在更短的时间内提供更多信息。
| TruSight Oncology 500 | TruSight Oncology 500 High-Throughput(大样本量方案) | TruSight Oncology 500 ctDNA v2 | |
|---|---|---|---|
| 分析时间 | 4-5天完成从样本起始到最终结果的整个流程 | 4-5天完成从样本起始到最终结果的整个流程 | 从纯化核酸到出具变异结果仅需 2.5–4 天 |
| 自动化功能 | 液体处理机器人 | 液体处理机器人 | |
| 自动化详情 | 探索可用的自动化方法 | 探索可用的自动化方法 | |
| 癌症类型 | 泛癌种, 实体瘤 | 泛癌种, 实体瘤 | 泛癌种, 实体瘤 |
| 试剂盒应用 |
对523个基因的DNA和55个基因的RNA进行靶向测序,panel总共1.94 Mb。包括MSI和TMB检测。 整合的HRD检测panel † 覆盖约25,000个SNP,可通过由Myriad Genetics提供支持的综合基因组不稳定性评分(LOH+TAI+LST)来评估同源重组修复缺陷。 †日本尚不支持购买TruSight Oncology 500 v2 |
靶向测序523个目标基因的DNA和55个基因的RNA,panel大小总计为1.94 Mb。包括MSI和TMB测量。 | DNA 靶向测序,panel 总大小 1.94 Mb:523 个基因用于小变异检测,59 个基因用于 CNV 检测,23 个基因用于基因重排检测,bMSI(> 2300 个位点),bTMB(1.94 Mb)。 |
| 说明 | 可利用FFPE组织中的DNA和RNA对实体瘤进行全景变异分析。通过单个样本实现实现变异检测和生物标志物评估,以进行广泛的肿瘤特征分析。 | 使用NextSeq™ 1000测序仪、NextSeq™ 2000测序仪、NovaSeq™ 6000测序仪、NovaSeq™ 6000Dx仪器(研究模式)或NovaSeq™ X系列,通过一体化的工作流程进行高通量全面NGS检测,以识别指南和1000多项临床试验中的关键生物标志物。包括免疫肿瘤学生物标志物TMB和MSI的覆盖范围。 |
为液体活检样本(血浆ctDNA)的全景变异分析提供了一种非侵入性的研究方法。这种液体活检方法使用微创样本采集方法补充基于组织的CGP,从而提供了关于肿瘤内和肿瘤间异质性的见解。
|
| 手动操作时间 |
自动工作流程约2.5小时 手动工作流程约10.5小时 |
自动工作流程约2.5小时 手动工作流程约10.5小时 |
自动化流程约 1.5 小时 手动流程约 2.5 小时 |
| 起始量 | 30 ng DNA(最低10 ng),40 ng RNA(最低20 ng) | 40 ng DNA和/或40–80 ng RNA | 20 ng cfDNA(4 mL血浆) |
| 系统 | NextSeq 550桌面式基因测序仪, 研究模式下的NextSeq 550Dx, NextSeq 500桌面式基因测序仪 | 研究模式下的NovaSeq 6000Dx, NovaSeq 6000基因测序仪 | NovaSeq 6000基因测序仪 |
| 方法 | 靶向DNA测序, 靶向RNA测序, 靶向富集 | 靶向DNA测序, 靶向RNA测序, 靶向富集 | 靶向DNA测序, 靶向富集 |
| 多重分析 | NextSeq 550/Dx:8样本/运行。 NextSeq™ 1000和2000:P2流动槽运行8样本,P3流动槽24样本,P4流动槽36样本。NovaSeq™ 6000/Dx:SP流动槽运行16样本,S1流动槽32样本,S2流动槽72样本,S4流动槽192样本。 NovaSeq X/X Plus:1.5B卡盒分析32样本,10B卡盒192样本,25B卡盒480样本。 |
NextSeq 1000 和 2000:P2 流动槽 8 个样本,P3 流动槽 24 个样本,P4 流动槽 36 个样本。 NovaSeq X 系列 *:1.5B 试剂盒 32 个样本,10B 试剂盒 192 个样本,25B 试剂盒 480 个样本。 |
NextSeq 2000 测序仪:P4 流动槽可运行 4 个样本 NovaSeq 6000 测序仪:S1 流动槽可运行 4 个样本,S2 流动槽可运行 8 个样本,S4 流动槽可运行 24 个样本。 NovaSeq X 系列测序仪:1.5B 流动槽可运行 4 个样本,10B 流动槽可运行 24 个样本,25B 流动槽可运行 64 个样本。 |
| 核酸类型 | DNA, RNA | DNA, RNA | DNA |
| 特殊的样本类型 | FFPE组织 | FFPE组织 | 循环肿瘤DNA, 血液 |
| 物种 | 人 | 人 | 人 |
| 技术 | Illumina测序 | Illumina测序 | Illumina测序 |
| 变异类别 | 基因融合, 转录本变异, 单核苷酸位点变异(SNV), 插入缺失(indel), 拷贝数变异(CNV), 杂合性缺失(LOH), 体细胞变异, 新型转录本, 单核苷酸多态性(SNP), 结构变异 | 基因融合, 体细胞变异, 新型转录本, 结构变异, 转录本变异, 单核苷酸位点变异(SNV), 插入缺失(indel), 拷贝数变异(CNV) | 单核苷酸位点变异(SNV), 插入缺失(indel), 拷贝数变异(CNV) |
| 泛癌种:BRAF、NTRK1、NTRK2、NTRK3、RET、MSI、TMB | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 有意义的生物标志物基因* | 具有潜在意义的生物标志物基因† | ||||||||||
乳腺癌 |
BRCA1 | BRCA2 | ERBB2 | ESR1 | PALB2 | PIK3CA | 180 | ||||
结直肠癌 |
ERBB2 | KRAS | NRAS | 166 | |||||||
骨癌 |
EGFR | ERG | ETV1 | ETV4 | EWSR1 | FEV | FLI1 | FUS | H3F3A | HEY1 | 140 |
| IDH1 | MDM2 | NCOA2 | SMARCB1 | ||||||||
肺癌 |
ALK | EGFR | ERBB2 | KRAS | MET | NUTM1 | ROS1 | 223 | |||
黑色素瘤 |
KIT | NRAS | ROS1 | 172 | |||||||
卵巢癌 |
BRCA1 | BRCA2 | FOXL2 | 149 | |||||||
CNS |
APC | ATRX | CDKN2A | CDKN2B | EGFR | H3F3A | HIST1H3B | HIST1H3C | IDH1 | IDH2 | 140 |
| MYCN | PTCH1 | RELA | TERT | TP53 | |||||||
前列腺癌 |
AR | ATM | BARD1 | BRCA1 | BRCA2 | BRIP1 | CDK12 | CHEK1 | CHEK2 | FANCL | 151 |
| FGFR2 | FGFR3 | PALB2 | RAD51B | RAD51C | RAD51D | RAD54L | |||||
甲状腺癌 |
HRAS | KRAS | NRAS | RET | TERT | 165 | |||||
子宫和宫颈 |
BRCA2 | EPC1 | ERBB2 | ESR1 | FOXO1 | GREB1 | JAZF1 | NCOA2 | NCOA3 | NUTM2A | 138 |
| NUTM2B | PAX3 | PAX7 | PHF1 | POLE | SMARCA4 | SUZ12 | TP53 | YWHAE | |||
其他实体瘤 |
ALK | APC | ARID1A | ASPSCR1 | ATF1 | ATIC | BAP1 | BCOR | BRCA1 | BRCA2 | 152 |
| CAMTA1 | CARS | CCNB2 | CDK4 | CDKN2A | CIC | CITED2 | CLTC | COL1A1 | COL6A3 | ||
| CREB1 | CREB3L1 | CREB3L2 | CSF1 | CTNNB1 | DDIT3 | DDX3X | DNAJB1 | DUX4 | EED | ||
| EGFR | ERBB2 | ERG | ETV1 | ETV4 | ETV6 | EWSR1 | FEV | FGFR2 | FGFR3 | ||
| FLI1 | FOXL2 | FOXO1 | FOXO4 | FUS | GLI1 | HEY1 | HGF | HMGA2 | IDH1 | ||
| KRAS | LEUTX | MAML3 | MDM2 | MYB | MYOD1 | NAB2 | NCOA2 | NF1 | NFATC2 | ||
| NFIB | NR4A3 | NRAS | NUTMI | NUTM2A | NUTM2B | PALB2 | PATZ1 | PAX3 | PAX7 | ||
| PDGFB | PDGFRA | PRKACA | PRKD1 | RANBP2 | ROS1 | SDHA | SDHB | SDHC | SDHD | ||
| SMARCB1 | SS18 | SSX1 | SSX2 | SSX4 | STAT6 | SUZ12 | TAF15 | TCF12 | TERT | ||
| TFE3 | TFEB | TFG | TP53 | TPM3 | TPM4 | TRAF7 | TSPAN31 | VGLL2 | WT1 | ||
| WWTR1 | YAP1 | YWHAE | ZC3H7B | ||||||||
表中列出的基因和生物标志物只是panel所含基因的一部分。有关完整的基因列表,请参见TruSight Oncology 500数据表。
参考文献:
1. 根据存档数据计算。Illumina公司 2023年。
TruSight Oncology 500 HRD Kit(24样本)
20076480
TruSight Oncology 500 HRD Kit(包括HRD富集试剂。 不包括文库制备或测序核心试剂。 需要HRD分析许可证并单独出售。) 暂未在日本推出。
List Price:
Discounts:
TruSight Oncology 500 DNA Kit(48样本)
20028213
包含用于制备和富集多达48个DNA样本和16个标签的试剂。单独购买NextSeq 500/550测序试剂。
List Price:
Discounts:
TruSight Oncology 500 DNA Kitt,配合NextSeq使用(48样本)
20028214
包含用于制备和富集多达48个DNA样本、16个标签的试剂,以及NextSeq 500/550测序试剂。
List Price:
Discounts:
TruSight Oncology 500 DNA/RNA Bundle(16标签,24样本)
20028215
包含用于制备和富集多达24个DNA和RNA样本以及16个标签的试剂。单独购买NextSeq 500/550测序试剂。
List Price:
Discounts:
TruSight Oncology 500 DNA/RNA Bundle,配合NextSeq使用(16标签,24样本)
20028216
包括用于制备和富集多达24个DNA和RNA样本的试剂以及16个标签和NextSeq 500/550测序试剂。
List Price:
Discounts:
TruSight Oncology 500 DNA Kit plus Velsera解读报告(16标签,48样本)
20032624
包括使用Pierian Clinical Genomics Workspace制备和富集多达48个DNA样本、16个标签和数据解读报告的试剂。单独购买NextSeq 500/550测序试剂。
List Price:
Discounts:
TruSight Oncology 500 DNA Kit,配合NextSeq使用,外加Velsera解读报告(16标签,48样本)
20032625
包括用于制备和富集多达48个DNA样本和16个标签的试剂、使用Pierian Clinical Genomics Workspace的数据解读报告以及NextSeq 500/550测序试剂。
List Price:
Discounts:
TruSight Oncology 500 DNA/RNA Bundle plus Velsera解读报告 (16标签,24样本)
20032626
包括使用Pierian Clinical Genomics Workspace制备和富集多达24个DNA和RNA样本的试剂,以及16个标签和数据解读报告。单独购买NextSeq 500/550测序试剂。
List Price:
Discounts:
TruSight Oncology 500 DNA/RNA Kit,配合NextSeq和Velsera解读报告使用 (16标签,24样本)
20032627
包括用于制备和富集多达24个DNA和RNA样本以及16个标签的试剂、使用Pierian Clinical Genomics Workspace的数据解读报告以及NextSeq 500/550测序试剂。
List Price:
Discounts:
TruSight Oncology 500 DNA Automation Kit(16标签,64样本)
20045504
包含用于制备和富集多达64个DNA样本和16个标签的试剂。单独购买NextSeq 500/550测序试剂。用于自动化。
List Price:
Discounts:
TruSight Oncology 500 DNA Automation Kit,配合NextSeq使用(16标签,64样本)
20045505
包含用于制备和富集多达64个DNA样本和16个标签的试剂以及NextSeq 500/550测序试剂。用于自动化。
List Price:
Discounts:
TruSight Oncology 500 DNA Automation Kit plus Pierian解读报告(16标签,64样本)
20045506
包括使用Pierian Clinical Genomics Workspace制备和富集多达64个DNA样本的试剂、16个标签和数据解读报告。单独购买NextSeq 500/550测序试剂。用于自动化。
List Price:
Discounts:
TruSight Oncology 500 DNA Automation Kit和Pierian解读报告,配合NextSeq使用(16标签,64样本)
20045507
包括用于制备和富集多达64个DNA样本和16个标签的试剂、使用Pierian Clinical Genomics Workspace的数据解读报告以及NextSeq 500/550测序试剂。用于自动化。
List Price:
Discounts:
TruSight Oncology 500 DNA/RNA Automation Kit(16标签,32样本)
20045508
包含用于制备和富集多达32个DNA和RNA样本以及16个标签的试剂。单独购买NextSeq 500/550测序试剂。用于自动化。
List Price:
Discounts:
TruSight Oncology 500 DNA/RNA Automation Kit plus Pierian解读报告(16标签,32样本)
20045509
包括使用Pierian Clinical Genomics Workspace制备和富集多达32个DNA和RNA样本的试剂,以及16个标签和数据解读报告。单独购买NextSeq 500/550测序试剂。用于自动化。
List Price:
Discounts:
TruSight Oncology 500 DNA/RNA Automation Kit,配合NextSeq使用(16标签,32样本)
20045990
包括用于制备和富集多达32个DNA和RNA样本的试剂以及16个标签和NextSeq 500/550测序试剂。用于自动化。
List Price:
Discounts:
TruSight Oncology 500 DNA/RNA Automation Kit plus Pierian解读报告,配合NextSeq使用(16标签,32样本)
20045991
包括用于制备和富集多达32个DNA和RNA样本以及16个标签的试剂、使用Pierian Clinical Genomics Workspace的数据解读报告以及NextSeq 500/550测序试剂。用于自动化。
List Price:
Discounts:
TruSight Oncology 500培训(DNA,可选HRD)——客户现场
20031667
客户现场为期三天的实践指导,帮助用户熟悉TruSight Oncology 500工作流程的基本步骤。本课程为最多四名学员提供样本和文库制备、富集、测序和数据分析的实践培训。
List Price:
Discounts:
TruSight Oncology 500培训(DNA和RNA,可选HRD)——客户现场
20031668
在客户现场提供3.5天的手动操作指导,帮助用户熟悉TruSight Oncology 500工作流程的基本步骤。本课程为最多四名学员提供样本和文库制备、富集、测序和数据分析的实践培训。
List Price:
Discounts:
Illumina Connected Insights培训-远程
20092376
Illumina Connected Insights 远程培训——包含 5 小时线上产品培训。
信息学专业服务-远程
20071787
Illumina 信息学产品与解决方案的专业服务,包括软件部署、流程与工作流程开发、集成、网络配置、数据迁移、数据导入项目,以及其他基于项目的信息学咨询服务;服务以远程方式提供,具体内容由工作说明书界定。
Illumina DRAGEN Server v3
20040619
包括第一年的Avance Exchange支持。需要购买年度DRAGEN许可证。
List Price:
Discounts:
Illumina DRAGEN Server v4
20051343
包括第一年的Avance Exchange支持。需要购买年度DRAGEN许可证。
List Price:
Discounts:
DRAGEN TruSight Oncology 500 HRD分析软件,本地
20073738
包括TSO 500 HRD的本地分析软件许可证。
ICA基础版年度订阅
20044874
Illumina Connected Analytics(ICA)基础版年度订阅。该产品为TSO500客户免费提供1年ICA,包括测序仪器连接、数据管理功能、使用预先打包的工具。
ICA专业版年度订阅
20044876
Illumina Connected Analytics(ICA)专业版年度订阅。该产品包括1年的ICA访问权,包括测序仪器连接、数据管理功能、预包装工具的访问权,以及创建由工具、流程、数据仓库和笔记本组成的定制工作流程的能力。
ICA企业版年度订阅
20038994
Illumina Connected Analytics(ICA)企业版年度订阅。该产品包括1年的ICA企业版访问权,包括测序仪器连接、数据管理功能、定制和预包装分析工具,以及用于数据仓储和挖掘的基础模块。ICA Enterprise还包括可选的HIPPAA BAA(仅限美国)、单点登录(SSO)和服务水平协议(SLA)。
ICA Enterprise Service and Compliance Add-on(仅适用于基础版)
20066830
Illumina Connected Analytics(ICA)企业服务和合规性插件。本产品适用于ICA基础年度订阅1年,包括HIPPAA BAA(仅限美国)、单点登录(SSO)和服务水平协议(SLA)。
Illumina Analytics - 1 iCredit
20042038
iCredit用于在BaseSpace Sequence Hub或Illumina Connected Analytics上进行的数据存储和分析。
List Price:
Discounts:
Illumina Analytics Starter Pack - 1,000 iCredits
20042039
iCredit用于在BaseSpace Sequence Hub或Illumina Connected Analytics上进行的数据存储和分析。
List Price:
Discounts:
Illumina Analytics - 5,000 iCredits
20042040
iCredit用于在BaseSpace Sequence Hub或Illumina Connected Analytics上进行的数据存储和分析。
List Price:
Discounts:
Illumina Analytics - 50,000 iCredits
20042041
iCredit用于在BaseSpace Sequence Hub或Illumina Connected Analytics上进行的数据存储和分析。
List Price:
Discounts:
Illumina Analytics - 100,000 iCredits
20042042
iCredit用于在BaseSpace Sequence Hub或Illumina Connected Analytics上进行的数据存储和分析。
List Price:
Discounts:
Illumina Connected Insights-年度订阅
20090137
Illumina Connected Insights 平台年度订阅。
Illumina Connected Insights-肿瘤学基因组等效样本-VCF
20090138
Illumina Connected Insights 肿瘤样本预付包(按基因组当量计,从 VCF 开始):1 个基因组当量 = 2 个外显子组 + 3 个大 Panel + 6 个小 Panel。只要每年续订 Illumina Connected Insights 年度订阅(20090137),未用完的当量可自动结转至下年;套餐已包含多套肿瘤知识库访问权限。
显示 /
产品
数量
单价
产品
货号
数量
单价
两种检测之间的主要区别在于规模。TruSight Oncology 500在NextSeq 550或NextSeq 550Dx仪器(研究模式)上运行,一次最多可批量处理8个样本。TruSight Oncology 500 HT在NovaSeq 6000系统或NovaSeq 6000Dx仪器(研究模式)上运行,一次可批量处理16–192个样本,具有可扩展性,可提高样本通量。有关其他差异,请参见本页的比较表。
分析经过优化,最小读长为2×101 bp。低至75 bp的读长可能有效,但这尚未得到充分验证。
是的,您可以使用供应商开发的方法自动化TruSight Oncology 500工作流程。
Illumina DRAGEN二级分析平台以非DRAGEN选项两倍的速度提供更高的变异检出准确性1。更高的准确性为样本QC、复杂变异、小变异、融合和剪接变异以及BRCA1/BRCA2的外显子水平CNV检出提供了更好的性能。DRAGEN流程还与TruSight Oncology 500 HRD检测兼容,可用于HRD鉴定。
是的,您可以使用自己的软件进行分析。不过,在此情况下,因美纳将无法直接提供技术支持。
填写以下表格,获得关于TruSight Oncology 500首次购买程序的信息。
Your email address is never shared with third parties.