NovaSeq X系列
将先进的化学、光学和信息学技术相结合,实现了超凡的速度和数据质量、出色的通量和可扩展性。
使用能够检测血浆中ctDNA的关键IO基因特征(TMB、MSI)以及所有主要变异类别的泛癌panel进行CGP分析。
分析时间
手动操作时间
起始量
此产品仅在某些选定区域可用。请选择 您希望发货的目的地 ,查看该产品是否在该区域可用。
TruSight Oncology 500 ctDNA v2现已上市,具有更高的灵敏度,使用更低的cfDNA起始量、更短的周转时间和更一体化的工作流程。
TruSight Oncology 500 ctDNA v2是一种泛癌种NGS检测,能够对血浆中的循环肿瘤DNA(ctDNA)进行内部全景变异分析(CGP),用于研究。
使用基于UMI的杂交捕获文库制备和深度测序,以低起始量(20 ng)实现灵敏准确的检测(SNV为0.2% VAF)。
DRAGEN二级分析使用Illumina Connected Analytics在本地或云端支持快速变异检出算法。使用Illumina Connected Insights*或Velsera的集成报告获取见解。
先进的化学技术和广泛的工作流程优化,可实现一天的文库制备和富集,总周转时间<4天。自动化友好的试剂盒和方法可提高效率。
*部分国家/地区上市。Illumina Connected Insights通过对第三方知识库的API调用,支持用户自定义的三级分析。
利用TruSight Oncology 500产品线识别可干预变异。
TruSight Oncology 500 ctDNA v2
分析血浆中的循环肿瘤DNA(ctDNA),DNA panel内容与TruSight Oncology 500相似。
评估FFPE肿瘤组织中的相关DNA和RNA癌症生物标志物(现可通过配套试剂盒支持检测HRD),可评估基因组不稳定性评分(GIS)。†
TruSight Oncology 500 High-Throughput(大样本量方案)检测
使用与TruSight Oncology 500相同的panel内容和组织起始量类型时,一次最多可批量处理192个样本。
†HRD仅适用于在TruSight Oncology 500试剂盒中加入TruSight Oncology 500 HRD试剂盒的情况。暂未在日本推出。
| 分析灵敏度 | ≥ 90%(SNV,≥ 0.2% VAF),≥ 95%(SNV 热点,≥ 0.2% VAF) |
|---|---|
| 分析特异性 | ≥99.995%(小变异,≥ 0.5% VAF) |
| 分析时间 | 从纯化核酸到出具变异结果仅需 2.5–4 天 |
| 癌症类型 | 泛癌种, 实体瘤 |
| 内容说明 | DNA 靶向测序,panel 总大小 1.94 Mb:523 个基因用于小变异检测,59 个基因用于 CNV 检测,23 个基因用于基因重排检测,bMSI(> 2300 个位点),bTMB(1.94 Mb)。 |
| 说明 |
为液体活检样本(血浆ctDNA)的全景变异分析提供了一种非侵入性的研究方法。这种液体活检方法使用微创样本采集方法补充基于组织的CGP,从而提供了关于肿瘤内和肿瘤间异质性的见解。 |
| 基因计数 | 523个基因的DNA |
| 手动操作时间 |
自动化流程约 1.5 小时 手动流程约 2.5 小时 |
| 起始量 | 20 ng cfDNA(4 mL血浆) |
| 系统 | NovaSeq 6000基因测序仪 |
| 作用机制 | 杂交捕获化学试剂 |
| 方法 | 靶向DNA测序, 靶向富集 |
| 多重分析 |
NextSeq 2000 测序仪:P4 流动槽可运行 4 个样本 NovaSeq 6000 测序仪:S1 流动槽可运行 4 个样本,S2 流动槽可运行 8 个样本,S4 流动槽可运行 24 个样本。 NovaSeq X 系列测序仪:1.5B 流动槽可运行 4 个样本,10B 流动槽可运行 24 个样本,25B 流动槽可运行 64 个样本。 |
| 核酸类型 | DNA |
| 特殊的样本类型 | 循环肿瘤DNA, 血液 |
| 物种 | 人 |
| 技术 | Illumina测序 |
| 变异类别 | 单核苷酸位点变异(SNV), 插入缺失(indel), 拷贝数变异(CNV) |
要运行 TruSight Oncology 500 ctDNA v2,您需要:
要使用DRAGEN流程进行分析,您需要:
要生成最终变异报告,您需要:
* 并非所有国家/地区均提供。Illumina Connected Insights通过对第三方知识库的API调用,支持用户自定义的三级分析。
† Velsera原名为Pierian。其他商业选项也可用。
TruSight Oncology 500 ctDNA v2检测
*Novaseq X和NovaSeq 6000Dx(RUO模式)兼容性将于2024年推出。
†并非所有国家/地区均提供。Illumina Connected Insights通过对第三方知识库的API调用,支持用户自定义的三级分析。
| 仪器 | 推荐的样本数 | 读长 |
|---|---|---|
| NovaSeq 6000基因测序仪 | 每次运行24个样本(S4流动槽),800 M双端read,35,000x覆盖度 |
2 × 150 bp |
| NovaSeq 6000基因测序仪 | 每次运行8个样本(S2流动槽),800 M双端read,35,000x覆盖度 |
2 × 150 bp |
新一代测序提供了对肿瘤分子基础的深入了解,可以帮助推进个性化医疗的前景。
我们的临床癌症研究解决方案能提供准确的基因组信息,让实验室能够在单次检测中分析多个基因。
| TruSight Oncology 500 ctDNA v2 | TruSight Oncology 500 | TruSight Oncology 500 High-Throughput(大样本量方案) | |
|---|---|---|---|
| 分析灵敏度 | ≥ 90%(SNV,≥ 0.2% VAF),≥ 95%(SNV 热点,≥ 0.2% VAF) | ||
| 分析特异性 | ≥99.995%(小变异,≥ 0.5% VAF) | ||
| 分析时间 | 从纯化核酸到出具变异结果仅需 2.5–4 天 | 4-5天完成从样本起始到最终结果的整个流程 | 4-5天完成从样本起始到最终结果的整个流程 |
| 癌症类型 | 泛癌种, 实体瘤 | 泛癌种, 实体瘤 | 泛癌种, 实体瘤 |
| 内容说明 | DNA 靶向测序,panel 总大小 1.94 Mb:523 个基因用于小变异检测,59 个基因用于 CNV 检测,23 个基因用于基因重排检测,bMSI(> 2300 个位点),bTMB(1.94 Mb)。 |
对523个基因的DNA和55个基因的RNA进行靶向测序,panel总共1.94 Mb。包括MSI和TMB检测。 整合的HRD检测panel † 覆盖约25,000个SNP,可通过由Myriad Genetics提供支持的综合基因组不稳定性评分(LOH+TAI+LST)来评估同源重组修复缺陷。 †日本尚不支持购买TruSight Oncology 500 v2 |
靶向测序523个目标基因的DNA和55个基因的RNA,panel大小总计为1.94 Mb。包括MSI和TMB测量。 |
| 说明 |
为液体活检样本(血浆ctDNA)的全景变异分析提供了一种非侵入性的研究方法。这种液体活检方法使用微创样本采集方法补充基于组织的CGP,从而提供了关于肿瘤内和肿瘤间异质性的见解。
|
可利用FFPE组织中的DNA和RNA对实体瘤进行全景变异分析。通过单个样本实现实现变异检测和生物标志物评估,以进行广泛的肿瘤特征分析。 | 使用NextSeq™ 1000测序仪、NextSeq™ 2000测序仪、NovaSeq™ 6000测序仪、NovaSeq™ 6000Dx仪器(研究模式)或NovaSeq™ X系列,通过一体化的工作流程进行高通量全面NGS检测,以识别指南和1000多项临床试验中的关键生物标志物。包括免疫肿瘤学生物标志物TMB和MSI的覆盖范围。 |
| 基因计数 | 523个基因的DNA | ||
| 手动操作时间 |
自动化流程约 1.5 小时 手动流程约 2.5 小时 |
自动工作流程约2.5小时 手动工作流程约10.5小时 |
自动工作流程约2.5小时 手动工作流程约10.5小时 |
| 起始量 | 20 ng cfDNA(4 mL血浆) | 30 ng DNA(最低10 ng),40 ng RNA(最低20 ng) | 40 ng DNA和/或40–80 ng RNA |
| 系统 | NovaSeq 6000基因测序仪 | NextSeq 550桌面式基因测序仪, 研究模式下的NextSeq 550Dx, NextSeq 500桌面式基因测序仪 | 研究模式下的NovaSeq 6000Dx, NovaSeq 6000基因测序仪 |
| 作用机制 | 杂交捕获化学试剂 | ||
| 方法 | 靶向DNA测序, 靶向富集 | 靶向DNA测序, 靶向RNA测序, 靶向富集 | 靶向DNA测序, 靶向RNA测序, 靶向富集 |
| 多重分析 |
NextSeq 2000 测序仪:P4 流动槽可运行 4 个样本 NovaSeq 6000 测序仪:S1 流动槽可运行 4 个样本,S2 流动槽可运行 8 个样本,S4 流动槽可运行 24 个样本。 NovaSeq X 系列测序仪:1.5B 流动槽可运行 4 个样本,10B 流动槽可运行 24 个样本,25B 流动槽可运行 64 个样本。 |
NextSeq 550/Dx:8样本/运行。 NextSeq™ 1000和2000:P2流动槽运行8样本,P3流动槽24样本,P4流动槽36样本。NovaSeq™ 6000/Dx:SP流动槽运行16样本,S1流动槽32样本,S2流动槽72样本,S4流动槽192样本。 NovaSeq X/X Plus:1.5B卡盒分析32样本,10B卡盒192样本,25B卡盒480样本。 |
NextSeq 1000 和 2000:P2 流动槽 8 个样本,P3 流动槽 24 个样本,P4 流动槽 36 个样本。 NovaSeq X 系列 *:1.5B 试剂盒 32 个样本,10B 试剂盒 192 个样本,25B 试剂盒 480 个样本。 |
| 核酸类型 | DNA | DNA, RNA | DNA, RNA |
| 特殊的样本类型 | 循环肿瘤DNA, 血液 | FFPE组织 | FFPE组织 |
| 物种 | 人 | 人 | 人 |
| 技术 | Illumina测序 | Illumina测序 | Illumina测序 |
| 变异类别 | 单核苷酸位点变异(SNV), 插入缺失(indel), 拷贝数变异(CNV) | 基因融合, 转录本变异, 单核苷酸位点变异(SNV), 插入缺失(indel), 拷贝数变异(CNV), 杂合性缺失(LOH), 体细胞变异, 新型转录本, 单核苷酸多态性(SNP), 结构变异 | 基因融合, 体细胞变异, 新型转录本, 结构变异, 转录本变异, 单核苷酸位点变异(SNV), 插入缺失(indel), 拷贝数变异(CNV) |
* 基于Pierian临床知识库,截至2023年2月。
* RUO模式下的NovaSeq 6000Dx系统需要一台独立的DRAGEN服务器进行二级分析。
* NovaSeq X和NovaSeq 6000 Dx兼容性将于2024年推出
低VAF下的小核苷酸变异检测
将每个单核苷酸变异的已知变异等位基因频率(VAF)的合成对照样本稀释至0.20%–0.50% VAF的值,并通过TruSight Oncology 500 ctDNA v2进行分析。
低VAF下的插入缺失检测
将已知每个插入或缺失的VAF的合成对照样本稀释至0.20%–0.50% VAF值,然后使用TruSight Oncology 500 ctDNA v2进行分析。
与肿瘤-正常检出相比,TMB相关性高
与肿瘤-正常工作流程相比,TSO 500 ctDNA v2的仅肿瘤工作流程利用先进的生物信息学进行生殖系和CH变异过滤,产生高度一致的bTMB。
用于免疫肿瘤学研究的灵敏MSI检测
在已知MSI高状态的3个细胞系(样本1–3)中评估微卫星不稳定性(MSI),并检测低至0.3%的肿瘤分数,评估多达约2300个均聚物位点。
CNV的分析性能,扩增的LOD≥1.3倍,缺失的LOD≤0.6倍
由于起始拷贝数较少,检测限导致相对MYC检测速度更快。 Illumina存档数据,2023年。
LOD检测基因重排的分析性能(0.5%)
VAF的计算方法为支持read总数除以断裂点两侧的较高深度。因美纳2023年存档数据。
了解这项共同努力,加速开发基于基因组信息的个性化治疗。
TruSight Oncology 500 ctDNA v2(24样本)
20105899
TSO 500 ctDNA v2手动试剂盒
List Price:
Discounts:
TruSight Oncology 500 ctDNA v2,配合NovaSeq 6000 S2流动槽使用(24样本)
20105901
混合工作流程TSO 500 ctDNA v2 + S2 FC手动试剂盒
List Price:
Discounts:
TruSight Oncology 500 ctDNA v2,配合NovaSeq 6000 S4流动槽使用(24样本)
20105902
混合工作流程TSO 500 ctDNA v2 + S4 FC手动试剂盒
List Price:
Discounts:
TruSight Oncology 500 ctDNA v2(24样本)加Velsera解读报告
20105905
TSO 500 ctDNA v2手动试剂盒 + Velsera解读报告
List Price:
Discounts:
TruSight Oncology 500 ctDNA v2 plus Velsera解读报告,配合NovaSeq 6000 S2流动槽使用(24样本)
20105907
混合工作流程TSO 500 ctDNA v2 + S2 FC手动试剂盒 + Velsera解读报告
List Price:
Discounts:
TruSight Oncology 500 ctDNA v2 plus Velsera解读报告,配合NovaSeq 6000 S4流动槽使用(24样本)
20105908
混合工作流程TSO 500 ctDNA v2 + S4 FC手动试剂盒 + Velsera解读报告
List Price:
Discounts:
TruSight Oncology 500 ctDNA Kit(48样本)
20039252
TruSight Oncology 500 ctDNA Kit(包括DNA文库和富集试剂);不包括NovaSeq核心试剂。
List Price:
Discounts:
TruSight Oncology 500 ctDNA Kit plus Velsera解读报告(16标签,48样本)
20043410
包含文库制备试剂、富集试剂,以及数据解读报告(通过Velsera Clinical Genomics Workspac软件提供)。不包括NovaSeq系统核心试剂。
List Price:
Discounts:
TruSight Oncology 500 ctDNA Kit,配合NovaSeq 6000 S2使用(48样本)
20101995
TSO500 ctDNA和NovaSeq 6000 S2核心耗材的组合SKU
TruSight Oncology 500 ctDNA Kit,配合NovaSeq 6000 S4使用(48样本)
20101998
用于TSO500 ctDNA和NovaSeq 6000 S4核心耗材的组合SKU
TruSight Oncology 500 ctDNA Kit,配合NovaSeq 6000 S2和Velsera解读报告使用(16标签,48样本)
20102000
TSO500 ctDNA和NovaSeq 6000 S2核心耗材的组合SKU + Velsera报告
TruSight Oncology 500 ctDNA Kit,配合NovaSeq 6000 S4和Velsera解读报告使用(16标签,48样本)
20102001
TSO500 ctDNA和NovaSeq 6000 S4核心耗材的组合SKU + Velsera报告
IDT® for Illumina® UMI DNA/RNA UD Indexes Set A, Ligation(96个标签,96个样本)
20034701
UMI DNA Index Anchors(板 = 20031416,盒 = 20032620)+ Nextera Compatible Unique Dual Index A(销售试剂盒 = 20027213,板 = 20025019,盒 = 20026121)
List Price:
Discounts:
IDT® for Illumina® UMI DNA/RNA UD Indexes Set B, Ligation(96标签,96样本)
20034702
IDT for Illumina UMI DNA Index Anchors Set B
List Price:
Discounts:
IDT for Illumina UMI DNA/DNA Index Anchors Set A for Automation
20066404
包括一盒96个IDT for Illumina - UMI DNA/RNA UD Indexes Set A for Automation,足以标记96个样本,一盒96个IDT for Illumina - UMI DNA Index Anchors for Automation。
List Price:
Discounts:
IDT for Illumina UMI DNA/DNA Index Anchors Set B for Automation
20063213
包括一盒96个IDT for Illumina - UMI DNA/RNA UD Indexes Set B for Automation,足以标记96个样本,一盒96个IDT for Illumina - UMI DNA Index Anchors for Automation。
List Price:
Discounts:
NovaSeq 6000 v1.5试剂盒 (300循环)
20028314
包含一个 S2 流动槽、一个缓冲液夹盒、一个簇生成夹盒和一个测序夹盒,以支持在 NovaSeq 6000 系统上进行 300 次循环运行。
List Price:
Discounts:
NovaSeq 6000 S4 v1.5试剂盒 (300循环)
20028312
包含一个 S4 流动槽、一个缓冲液夹盒、一个簇生成夹盒和一个测序夹盒,以支持在 NovaSeq 6000 系统上进行 300 次循环运行。
List Price:
Discounts:
Illumina DRAGEN Server v4
20051343
包括第一年的Avance Exchange支持。需要购买年度DRAGEN许可证。
List Price:
Discounts:
ICA基础版年度订阅
20044874
Illumina Connected Analytics(ICA)基础版年度订阅。该产品为TSO500客户免费提供1年ICA,包括测序仪器连接、数据管理功能、使用预先打包的工具。
ICA专业版年度订阅
20044876
Illumina Connected Analytics(ICA)专业版年度订阅。该产品包括1年的ICA访问权,包括测序仪器连接、数据管理功能、预包装工具的访问权,以及创建由工具、流程、数据仓库和笔记本组成的定制工作流程的能力。
ICA企业版年度订阅
20038994
Illumina Connected Analytics(ICA)企业版年度订阅。该产品包括1年的ICA企业版访问权,包括测序仪器连接、数据管理功能、定制和预包装分析工具,以及用于数据仓储和挖掘的基础模块。ICA Enterprise还包括可选的HIPPAA BAA(仅限美国)、单点登录(SSO)和服务水平协议(SLA)。
ICA Enterprise Service and Compliance Add-on(仅适用于基础版)
20066830
Illumina Connected Analytics(ICA)企业服务和合规性插件。本产品适用于ICA基础年度订阅1年,包括HIPPAA BAA(仅限美国)、单点登录(SSO)和服务水平协议(SLA)。
Illumina Analytics - 1 iCredit
20042038
iCredit用于在BaseSpace Sequence Hub或Illumina Connected Analytics上进行的数据存储和分析。
List Price:
Discounts:
Illumina Analytics Starter Pack - 1,000 iCredits
20042039
iCredit用于在BaseSpace Sequence Hub或Illumina Connected Analytics上进行的数据存储和分析。
List Price:
Discounts:
Illumina Analytics - 5,000 iCredits
20042040
iCredit用于在BaseSpace Sequence Hub或Illumina Connected Analytics上进行的数据存储和分析。
List Price:
Discounts:
Illumina Analytics - 50,000 iCredits
20042041
iCredit用于在BaseSpace Sequence Hub或Illumina Connected Analytics上进行的数据存储和分析。
List Price:
Discounts:
Illumina Analytics - 100,000 iCredits
20042042
iCredit用于在BaseSpace Sequence Hub或Illumina Connected Analytics上进行的数据存储和分析。
List Price:
Discounts:
Illumina Connected Insights-年度订阅
20090137
Illumina Connected Insights 平台年度订阅。
Illumina Connected Insights-肿瘤学基因组等效样本-VCF
20090138
Illumina Connected Insights 肿瘤样本预付包(按基因组当量计,从 VCF 开始):1 个基因组当量 = 2 个外显子组 + 3 个大 Panel + 6 个小 Panel。只要每年续订 Illumina Connected Insights 年度订阅(20090137),未用完的当量可自动结转至下年;套餐已包含多套肿瘤知识库访问权限。
Illumina Connected Insights-肿瘤学基因组等效样本-VCF
20090138
Illumina Connected Insights 肿瘤样本预付包(按基因组当量计,从 VCF 开始):1 个基因组当量 = 2 个外显子组 + 3 个大 Panel + 6 个小 Panel。只要每年续订 Illumina Connected Insights 年度订阅(20090137),未用完的当量可自动结转至下年;套餐已包含多套肿瘤知识库访问权限。
信息学专业服务-远程
20071787
Illumina 信息学产品与解决方案的专业服务,包括软件部署、流程与工作流程开发、集成、网络配置、数据迁移、数据导入项目,以及其他基于项目的信息学咨询服务;服务以远程方式提供,具体内容由工作说明书界定。
Illumina Connected Insights培训-远程
20092376
Illumina Connected Insights 远程培训——包含 5 小时线上产品培训。
显示 /
产品
数量
单价
产品
货号
数量
单价
TruSight Oncology 500 ctDNA v2是一种针对实体瘤的超灵敏、一体化液体活检检测,可在<4天内完成血浆样本的CGP。与原始的TruSight Oncology 500 ctDNA检测相比,TruSight Oncology 500 ctDNA v2通过更低的cfDNA起始量、更快的周转时间和更精简的工作流程提高了灵敏度。TruSight Oncology 500和TruSight Oncology 500 High-Throughput可实现组织样本的CGP;请参阅TruSight Oncology检测比较表中的其他差异。
TruSight Oncology 500 ctDNA v2分析工作流程使用在DRAGEN v4或v3服务器或Illumina Connected Analytics平台上运行的脱机版软件来生成样本输出,包括高级样本指标、检测到的变异以及TMB和MSI评分。使用Illumina Connected Insights或Velsera CGW进行三级分析。
BaseSpace Sequence Hub 评估应用程序也仅供评估使用。因美纳没有义务为该应用程序提供技术支持。访问期限为30天。
深入了解 兼容的分析软件 产品。
在DRAGEN服务器上分析24个文库的S4运行大约需要20-24小时,分析8个文库的S2运行大约需要9-12小时。
是的,您可以使用自己的软件进行分析。不过,在此情况下,因美纳将无法直接提供技术支持。
建议使用约20 ng起始量cfDNA,以>90%的灵敏度和>95%的特异性对SNV进行约0.2%的VAF检测;但是,该检测可以接受10-30 ng的起始量。
请联系我们,了解我们产品和服务的相关信息,或获取技术支持。
Your email address is never shared with third parties.