Illumina Protein Prep

Illumina Protein Prep结合了值得信赖的因美纳化学技术、SOMAmer技术和DRAGEN数据分析,提供了基于NGS的全面、自动化的蛋白质组学解决方案。

约2.5天

分析时间

约4小时

手动操作时间

55 µL人血浆或血清

起始量

详情请参见规格表

现可抢先体验Illumina Protein Prep
现可抢先体验我们的创新解决方案,可检测血浆和血清样本中6000种不同的人类蛋白质(可提供的技术支持有限)。

概述

Illumina Protein Prep使用基于SOMAmer的蛋白质组学检测技术和NGS读取,可以发现和定量200多种生物学通路中的人类蛋白质。 

主要特点

  • 使用NovaSeq基因测序仪进行NGS分析,可检测单个血浆或血清样本中超过6000种不同的人类蛋白质(2025年将可检测超过9000种蛋白质)

  • 2.5天内即可获得样本结果,手动操作时间仅4小时 

  • 通过BaseSpace Sequence Hub、DRAGEN二级分析、Illumina Connected Analytics和Partek Flow进行集成分析

经过严格验证

Illumina Protein Prep检测中使用的SOMAmer试剂在形状特异性和多离子竞争性方面经过严格测试,并通过质谱和ELISA(酶联免疫吸附测定)等方法进行了正交确认。

高灵敏度、宽动态范围和出色的准确性

Illumina Protein Prep中使用的SOMAmer试剂提供飞摩尔级的灵敏度、高重现性以及10 Log动态范围。

高通量,支持扩展

整个工作流程可在单一平台上完成并且支持自动化,提供端到端解决方案,每周可处理340个样本和44个对照,并无缝集成二级分析流程和全面的三级分析解决方案。

规格

需要的产品

Illumina Protein Prep自动化系统(需要一次性购买。必须使用Illumina Protein Prep自动化系统实现检测自动化。请联系您当地的因美纳客户经理,了解有关Illumina Protein Prep服务合作伙伴的更多信息)。 

 

根据您的起始样本类型选择血浆或血清检测:

Illumina Protein Prep 6K Plasma,96次反应(货号20104377)*,或

Illumina Protein Prep 6K Serum,96次反应(货号20104378)*

 

每个96次反应试剂盒选择一个标签板: 

Illumina DNA/RNA UD Indexes, Tagmentation(96标签,96样本) 

Set A (货号20091654)

Set B (货号20091656)

Set C (货号20091658)

Set D (货号20091660)

 

*Illumina Protein Prep现开放抢先体验。请联系因美纳专员了解详情。

/ 结果

应用

Illumina Protein Prep可生成直接用于测序的文库,以检测6000种独特的人类蛋白质,用于蛋白质组学发现和定量应用,包括生物标志物发现和群体遗传学研究。 

工作流程示例

1
文库制备

Illumina Protein Prep 6K,Plasma(96次反应)

2
测序
3
分析

计划推荐

仪器 推荐的样本数 读长
NovaSeq 6000基因测序仪

在S4 35c上,每个流动槽进行192次反应

40M reads, 1 x 35

NovaSeq X基因测序仪

在10B 100c上,每个流动槽进行192次反应

40M reads, 1 x 100

相关应用和方法

文档

产品资料
支持文档

此产品目前不提供专用支持部分

数据图

Overview of the Illumina Protein Prep solution

Illumina Protein Prep解决方案概览

使用人类血清或血浆样本作为SomaScan检测的起始材料,然后进行因美纳文库制备,在Illumina Protein Prep自动化系统上自动进行,并在NovaSeq™测序仪上进行测序。

Detecting protein abundance changes associated with menopause in plasma samples using microarrays and NGS

使用芯片和NGS检测血浆样本中与更年期相关的蛋白质丰度变化

利用芯片和NGS检测了三种更年期相关基因的差异表达。来自85名健康个体的血浆样本显示,年长女性的蛋白质水平较高。不同方法的数据具有可比性。基因:FSH、HCG和LH。

Summary of precision metrics shows consistently low CV

精确度指标汇总显示CV持续较低

多克隆抗体在结构和性能上可能存在差异,而SOMAmer试剂则不同,它基于结合动力学,具有fM级灵敏度和出色的可重现性,中位变异系数(CV)低于10%。

Protein-capture using the SOMAScan assay

使用SOMAScan检测法捕获蛋白质

SOMAmer试剂(蓝色)含有可光解接头和生物素。它们与链霉亲和素磁珠结合,捕获特定蛋白质并用生物素(黄色)标记。紫外线会破坏接头,释放出SOMAmer-蛋白质复合物,这些复合物会被新的磁珠捕获,然后洗脱下来,利用NGS进行定量分析。

lllumina Protein Prep NGS conversion chemistry

Illumina Protein Prep NGS转换化学方法

在Somascan检测之后,使用基于杂交的方法将SOMAmer试剂丰度转换为可用于条形码测序的文库。

文库制备 (2)

ILMN Protein Prep 6k Plasma, 96次反应

20104377

Library Prep Kit for Illumina Proteomics Assay – Plasma Sample type. LP kit enables 96 reactions(85 samples + 11 Controls)

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ILMN Protein Prep 6k Serum, 96次反应

20104378

Library Prep Kit for Illumina Proteomics Assay – Serum Sample type. LP kit enables 96 reactions(85 samples + 11 Controls)

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自动化 (1)

Illumina Protein Prep自动化系统

20116818

This package supports customers who wants to automate their Illumina Protein Prep Assay. It includes a Tecan Fluent OEM automation system equipped to run Illumina Protein Prep Assay protocols, robotic accessories, and the control software to run the assay.

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标签接头 (4)

Illumina® DNA/RNA UD Indexes Set A, Tagmentation(96标签,96样本)

20091654

Illumina® DNA/RNA UD Indexes Set A, Tagmentation(96个标签,96个样本)包括96个10 bp标签,足以标记96个样本。单独购买文库制备和富集试剂以及探针panel。

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Illumina® DNA/RNA UD Indexes Set B, Tagmentation (96标签, 96样本)

20091656

Illumina® DNA/RNA UD Indexes Set B, Tagmentation(96个标签,96个样本)包括96个10 bp标签,足以标记96个样本。单独购买文库制备和富集试剂以及探针panel。

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Illumina® DNA/RNA UD Indexes Set C, Tagmentation (96标签, 96样本)

20091658

Illumina® DNA/RNA UD Indexes Set C, Tagmentation(96个标签,96个样本)包括96个10 bp标签,足以标记96个样本。单独购买文库制备和富集试剂以及探针panel。

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Illumina® DNA/RNA UD Indexes Set D, Tagmentation (96标签, 96样本)

20091660

Illumina® DNA/RNA UD Indexes Set D, Tagmentation(96个标签,96个样本)包括96个10 bp标签,足以标记96个样本。单独购买文库制备和富集试剂以及探针panel。

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常见问题解答

Illumina Protein Prep使用SOMAmer技术(基于适配体)进行蛋白质捕获。请查看本页面“数据图”选项卡中的使用SOMAScan检测捕获蛋白质。

人血浆和血清样本。

Illumina Protein Prep 6K检测可检测超过6000种不同的人类蛋白质,并计划到2025年初扩展到超过9000种人类蛋白质。该panel可用于检测主要生物学通路中的蛋白质,包括与肿瘤学、神经学、炎症和心脏病学有关的蛋白质。

二级分析可生成蛋白质定量文件(ADAT)和QC报告。

/ 结果

NovaSeq X系列

将先进的化学、光学和信息学技术相结合,实现了超凡的速度和数据质量、出色的通量和可扩展性。

NovaSeq X系列试剂盒

NovaSeq X系列试剂盒包含试剂卡盒、缓冲液卡盒、流动槽、冻干插件、预装缓冲液和文库联管。

NovaSeq 6000试剂盒

用于NovaSeq 6000基因测序仪的试剂盒,由即用型预装试剂卡盒和流动槽组成。

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